在过去的十四年间，第一机体疑似出现了神化的第一形态，引发了前所未有的全球性动荡。这次事件后，原NERV的成员葛城美里等人离开组织，组建了反抗者联盟Wille，目标是对抗神出鬼没的seele组织和原本的机构。在Wille的指挥下，新一代的战士明日香与真理被派遣去夺回被封印在卫星轨道上的主角机体和真嗣，然而，关于真嗣登机的命令被严格禁止。在感受到来自身边的压力和敌意后，年少的真嗣在绫波丽的陪伴下，意外驾驶九号机，突入入侵的总部。在这里，他与心系的绫波重逢，也从父亲那里得知自己将面临的复杂命运，包括与青梅竹马的渚薰的关系。这部作品巧妙地融合了机战、心理剧与哲学思考，展现了人物在极端压力下的内心挣扎与成长。剧情高潮迭起，充满悬念与反转，令人不断反思人性与存在的意义。整体而言，这是一部不仅仅着眼于未来科幻战争，更深刻探讨人类精神世界的经典之作，值得细细品味。